Sequence retrieval

Genome: Clostridium difficile CD196
Start position: 2043569
End position: 2048080
Length: 4512

DNA sequence
>NC_013315, from 2043569 to 2048080 (4512 bp); Clostridium difficile CD196 ATGGCAACAGTATCAGGACAAATAGTTTTTGATAGAAATAGAAGTGCTACCATTGATTCTGGGGACTCAG GAATAGCCAATATACCAGTTGTATTACAAGATATAGCAACTGGAGTTAGACTTGTGGTTCTCACAGATGC ATCAGGAAATTATGTTTTTACTAATGTTCCAAATGGTAACTATAGAATTGTAGAAGCTTTTGGAACTACA GGAGGAGTACCAACACCAGGGAATTTTGCAACAGCGATAGTAGGTCCAGTTCCAATTGCAGAAATGCCAC CTATTAGTTCTGTGACAAATCCTCCTATTGGTTCAACAAACTTAGATGGTACAACACCTAACACACTATT AATAACAGTAGCAGGTTCAGATATAATAAATCAAAATATATTAAATGGGCCTGTGATTTATACACCTATA GAGAATATATTGGATTCTTGCGTGTCTGTATCTAATATAAACCTTATTACAGATGCAGATAACGGAACAT TCGGTTTTTTTCCACCAGGTACACCAAGTAATACAGGACCTGAAATAGAACCTTACCCAAATGTGACGCC AGATTTTACGTATGTTGTACCAGACCCAACTAAGTTTACACCTTTAGATGGAGAATATACAGTACAAAAT ATTATGACAAATGCAATGAGTAATGTTATAGGAGCTTGGTGGCGTATTGCTGACCATACTACAGGAAATG AAACAGGAAGAATGATGGTGGTAAATGGTTTTAATCCTGGAGCTGTATTTTTTAAATCAACAGTACAAGT TACACCTAACACTAATTATTTATTTAGCACTTGGATTTTAAACCTTTTTAAGGTAACAGGATATCCACCA CCACAGCTAGGTGTAAGAATATTTGACCAAAATAATAATATACTATATCAAGCAACATTAGGAGCTCAAA TTCCAGTTAATACAAACGCACCAGAATGGAAAGAAGTAGGTACTGTGATTAATTCTCAAAATAATAATCA ACTTACAGTAGAATTTTTTAGTGAAGGAGAAAGCGCCATTGGAAATGACTATGCTATAGATGATGTTTCT TTAAGAGAAATAGCTGTTCCAACCTTTACTCCAATAAAAACAAGTAACACAGAAACTGCTAATGTAGGTG ATATAATCACATATACAGTTACATTAGATAATACTTGTGATAGCCCTTTAACTAATGTATTTTTTAGGGA TTTAATTCCAAATGGTTTAGAGTTTATACCTGGAACTGTAACGGTTGATGGAGTATCTGTACCAGGAGTA GACCCTAATACAGGTTTTCCACTTCCAGATATTGGAGGAGGAATAGGGGTTGAAGTAACTTTTGATGTTG TGGTTGAAAGTATTCCTAACCCAAATCCTACTAATAATATAGCTACTATAGATTACTCCTATACACCTGT AGAAGGCGGTATACCAAATGATTTTTCAGTAGATTCTAATCCAGTTCCTGTTGAAGTAATCTCAGCAGAT GTTGAAGTTACAAAATTATCTGAACCTACTATAGTGAATCCAGGAGAGGAATTAATATACACTATAAAAG TAGTAAATAATGGACCATTCCCATCTGAGAATGTGGTTTTAACAGATGATGTACCAGCTTCTATTATAAA TCCAGAGTATTCATTAGATGGAGGAGTAACTTTTCAACCATGGACTGGAAGTTTAAATATAGGGACATTA GAAGTAGGAGAGACAAGAGTTATTATAATTAGGGGTATTGTAAATCCATCAACAGTAGGAATTATAACAA ATACAGCTGTAGTATCTTCAACTACAGCAGACCCAAACCTTAATAATAATACATCTACAATAGAGACAGA AGTGAATTTATTAGCAGATATTTTAGTAATGAAAACAGCAGAACCTAATTCAGCTGTTCCAGGTACTTTA TTGAGATATACTATTCAAGTAGAAAACTTAGGACCAGCAAATGCTGAAAATGTAATATTAAATGATGATA TTCCAGCCTCTATTATAAATCCAGAATATTCATTGGATGGAGGAGCAAGTTTTCAACCATGGAATGGAAG TCTTAATATAGGAACTTTAAACTCTGGAATTTCATTAACAGTTTTAATTCAAGGAACAGTTAGTTTAAAT TCTTCAGAATATATAGTAAATACAGCAACAGTTTCTTCAACTACACCTGACCCAGATTTAAGCAACAATA TATCTACCATTATTACACCAGTTAACCCACAAGCAGGTATTTCTATTATAAAAGTAGCTGACGAGGATGT AGCTGTTCCAGGAGAAGAATTTGTATATACAATTGAAATTTTTAATGAAGGACCATCTAATGCTACGAAT GTAGTTTTAACAGATGATATACCAGATGTTATTTTAAATCCAGAATATTCATTGGATGGAGGAGCAACTT TCCAACCATGGAATGGAAGTCTTAATATAGGTACAGTTGCACCAGGGCAATTAATAAGAATTATCATAAA GGGATTAGTAAGTTCAACTGCTACAGGAGATATTACTAATACAGCAGAAGTAAGTGCAGATGTACCAGAA CCAGTTACGGATTCATCAACAGTGACAACTCCTATAGTTCCATCAGCAGATATAGAAGTAATAAAAACTA GCAATATGGATACAGCAGTTCCAGGAGAAACTTTTAGTTATACTATAACAGTTATAAATTTAGGACCATC TGCTGCACAAAGTATCGTTTTGACAGATGATATACCAGATGTTATTTTAAATCCAGAGTATTCATTGGAT GGAGGAGTAACTTTCCAACCATGGAATGGAAATCTTAGTATAGGCACTTTGGATGCTGGAGAAATAAGAA GTATTATAATAAGAGGAACAGTGAGCCAGACAGCAGTAGGTACAATTATAAATACAGCAACAATAAGTTC ACCTACACCTGACCCAAATCCAGATAATAATACTTCAACAGATGAAACAGATATAAGTCCATTAGCAGAT ATTTCTGTGATAAAAGGCAACGAACCAGTTGCTATACCAGGGGGAAGATTTATTTATGGAATTGAAATTG CAAATGCAGGACCATCTTTTGCAGAGAACGTAACTTTAACAGATAATATACCAGCTTCTATTTTAAATCC AGAGTACTCAATAGATAATGGAGTGACTTTCCAACCATGGAATGGAAGCCTTAATATAGGTACTTTAGAT GCTGGAGAGATAAGAAATATCATAATAAGGGGAACAGTAAGTCAAACAGCAATAGGTACAATTATAAATA CAGCAACAGTAAGTTCAACTACACCTGACCCAAATCTAAATAACAATACTTCAACATCAGAAGCAGAGGT AAGTTCATCAGCAGATATTTCTGTAGTAAAACGAAGCAATCAGACTGTTGTTGTACCAGGAGATGTACTA GACTATACAATTGAGGTGAGAAATGCAGGACCGTCTACTGCTCAGAACGTAACTTTAACAGATAATATAC CAGCTTCTATTTTAAGTCCAGAATATTCAATAGATAATGGAGTGACTTTTCAACCATGGAATGGAAGTCT TAGTATAGGCACTTTAGATGCTGGAGAGATAAGAAATATTATAATAAGGGGAATAGTAAGTCAAACAGCA ATAGGTACAATTATAAATACAGCAACAGTAAGTTCAACTACACCTGACCCAAATCTAAATAACAATACTT CAACATCAGAAGCAGAGGTAAGTTCATCAGCAGATATTTCTGTAGTAAAACGAAGCAATCAGACTGTTGT CGTACCAGGCGATGTACTAGACTATACAATTGAGGTGATAAATGCAGGACCGTCTACTGCTCAGAACGTA ACTTTAACAGATAATATACCAGCTTCTATTTTAAGTCCAGAATATTCAATAGATAATGGAGTGACTTTTC AACCATGGAATGGAAGTCTTAGTATAGGCACTTTAGGTGCTGGAGAGATAAGAAATATCATAATAAGGGG AATAGTAAGTCAAACAGCAATAGGTACAATTATAAATACAGCAACAGTAAGTTCAACTACACCTGACCCA AATCTAAATAACAATACTTCAACATCAGAAATAGATATAAGTTCATCAGCAGATATTTCTGTAATAAAAT TAGCAAATAAAACAGAAGCATGTGTAGAAGAGCAAATAGATTTTGTAATAGTAGTATCAAATGCAGGACC AGAAAATGCTCAAAATGTTACTTTAATAGACAATGTTTCAGATAAGCTTAAGAAAGCAGTATTTTCACTT GATAGAGGTGTAAGTTTCCAACCATGGACTGGAAGTCTTAATATAGGTACACTACCAGCTGGAACTTTAA GAGTTATTCTATTAAGAGGAATTATAAAATCAACATGTCTTGATAGATTAACAAATATTGCAGAAGTTAC TTCAACAACACCAGATTCAAACCTTAACAATAATATATCAAGAGTGCAAGTAGAAATAAAACAATGTTGT TGTAATGATTGCTGTTGTAACAACTGTAGTAATTGTTGTTGCAATGATTGTGGTTGTAAAGATTGTTGCT GTAATTGTTGTAAAAATGACTTTTGGTGTTGA

Protein sequence (NCBI) or Translate to protein
Restriction digest
BLAST
Design primers with primer3
Genome related info at NCBI

Gene(s) or part of gene(s) amplified:
ORF.. 2043569-2048080	Sequence	CD196_1764 - cell surface protein