Sequence retrieval

Genome: Haemophilus influenzae F3047
Start position: 1216557
End position: 1223207
Length: 6651

DNA sequence
>NC_014922, from 1216557 to 1223207 (6651 bp); Haemophilus influenzae F3047 TTACCATTGGAAACCAATCCCTGCGCCTACTGCGTAATCTTTCTGAGAGGTTGCACCCGCCGTAGCTTTA AAGATCACCTTGTTGTTATCGCTACTTCGTGTGTAACCAACAGCCAGAGAACTTTGTCCGCGGAAGTTGC CTACCCCAATACCGATCATTGCGCCACCTGGCACTGACACGGTTGGAATATTCGCAATAGCGACCGCACT TGCGACACCCGCACTCAGTTTCTTATCTAACTTATTAACCTTGTTAGTTAAACGGTTTTCAACACCTTGA GTAGTCGAATTGAGCTGTCTTACAGTGACTGCATCAGACAATTCTTTACCATCTCTAATATTGCTCACTG TGCGATCACCCATGCTGACCGTATTGTCACGAGTGACAGTTTGATTTGAGCCAATAGCAACAGAATTGTT AGCACTTACTGTTGAGTTATGTCCGATTACCACCGAGTCTTTACCGCTGACACTCGAGGCTGAACCAATC ACGGTTGAATTTTCACCGCTCGCTTTACTGTCTTTACCTAATGAAACCGTGCCATTTGCGGTTGCATGGG CATTATGACCCAATGCTGTAGCATTTTTGCCAGTAGCTTGTGCATTTGTCCCCAATGCAGTTGTCATATT GCCAGACGCTTGTGAACTATGACCAATCGACACCGCACCATCGCCACTTGCAGTAGAATTCCAACCTAAT GCAGTTGCATTTACACCAGAGGCTTTTGCATCAGGCACAGATCCTTTATCCCCCGTGTGAGCTGCCGAGA AGGCAGTATGCACTTTTCCATCTGCATCACGCTCAAATAATCCTGAATCCTCAATTTGCTGCGCTGCTGT AGAAGCTTGTTGAGCCGAACTTGAAGCTGCGTTAGCAGAAGAGCTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGATGCT TGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAGCCGAACTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAG CAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCT TGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAGCCGAACTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCC GCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTGCATTGG CTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCT TGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCT GCGTTAGCAGAACTTGAAGCTGCATTGGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAG CTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCT TGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCT GCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAG CTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACT TGAAGCTTGTTGAGCAGAGCTTGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAGCCGAACTTGAAGCT GCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAG CAGAACTTGAAGCTGCATTGGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGA ACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGATGCT GCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTGCATTGGCTGATGAACTTGCCGCGTTAG CAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGA ACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCT GCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAG CAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGA ACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCTTGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTTGAAGCT TGTTGAGCCGAACTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAG CTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTGCATTGGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCT TGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCT GCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTGCATTGG CTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCT TGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCT GCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAG CTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCT TGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCTAGAAGCC TGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAGCCGAGCTAGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTAGAAGCTTGTTGTG CGGAGCTAGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTAGAAGCCTGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAGCCGAACT TGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCT GCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCTTGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAG CCGAACTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCCGCGTTAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAGCTGATGA ACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCT GCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCTTGATGCTGCGTTAG CTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCT TGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCTTGATGCT GCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAG CAGAGCTTGAAGCTGCGTTAGCTGATGAACTTGCTGCGTTAGCAGAACTTGAAGCTTGTTGAGCAGAGCT AGAAGCCTGTTGTGCGGAGCTTGAAGCTTGTTGAGCCGAGCTAGAAGCTTGTTGTGCGGAGCTAGAAGCT TGTTGCGCCGAGCTTGATGCTTGTTGTGCCGAGCTTGAAGCTGCGGTGGCAGAGCTGGCTGCGGCGCTGG CGGATGTGGATGCGGCGCTGGCGGATGTGGATGCTGCACTGGCGGATGTGGATGCCGCACTGGCGGATGT GGATGCCACACTGGCGGAGCTGGCTGCGCTGCTTGCGTAGCTTTTTGCTGTGCTAACTTGTGTATTAATT TCGTTTAATGTATTTGTTACTGTTTCGGCTGCGGCTGCTGCAGAAGAGATTGAGTCTTTTGCAGTTTGAC TTAATCCATAGATAATTTTGCCATTGCCGTCTGTGCTAACAGTAAGATCGGAGGTTGCGCCAAACGTGAT TTCGTTATCTTGGTTTAATGTCCACGTTTTAGCATTGCCAGTTTGAGTATTTCCCTCTGATTGAGCATTT TCGACTTTGAAAGTTTGTGTACGTCCTTCAAGTGCGGTCGCTTTTTCTGATGCTTTGTTTGCTGCATCTT GTGCTGTGCTTGCTAGGGTATTTAATTCTGTCGCAACGTGATAAAGCTGTGATCCGTTGATGGCATCGGT GGAGGTTGCTGTAATCTCACCTGCGCCTACGTTTTGAATTTGACGATTAACGGTTGAGTTACCGATAGAA AGCACACCTTGATTTGAGCCTAGAACAAAACCGTTTATATTTTTGTTATTTAAACTAAATGTTACATCGT GTTGTGTAGCTGTAACAGATCCGTTACCTAATGCAATATCACCATTTGTGATACTTGCCTGTGCGTTGTA ACCCAAGGCGATAGCGTTTTCTTTTGATGCGTTTGCATAACGCCCGATGGCTATTGTTTGGTTTGCAGAG GCATTTGCATTATTACCCATTGCAACAGAGAAATTTGCAATAGCTTTGGCATCAGGACCGACGGCAGACG CCCTCTCTCCTGTTGCTTGTGCGTTGTAACCCAAGGCGATAGCATTTTCTTTTGATGCGTTTGCGGAACG TCCGATGGCTATTGTTTGGTTTGCAGAGGCATTTGCATTATTACCCATTGCAACAGAGTAGTTTGAAATA GCTTTGGCATCAGGGCCGACGGCAGACGCCCTCTCTCCTGTTGCTTGTGCGTTGTAACCCAAGGCGATAG CGTTTTCTTTTGATGCGTTTGCGGAACGTCCGATGGCTATTGTTTGGTTTGCAGAGGCATTTGCACCATT ACCCATTGCAACAGAGTAGTTTGAAATAGCTTTGGCATCAGGGCCGACGGCAGACGCCCTCTCTCCTGTT GCTTGTGCGTTGTAACCCAAGGCGATAGCGTTTTCTTTTGATGCGTTTGCGGAACGTCCGATGGCTATTG TTTGGTTTGCAGAGGCATTTGCACCATTACCCATTGCAACAGAGTAGTTTGCAATAGCTTTGGCATCAGG ACCGACGGCAGACGCCCTCTCTCCTGTTGCTTGTGCGTTGTAACCCAAGGCGATAGCATTTTCTTTTGAT GCGTTTGCGGAACGTCCGATGGCTATTGTTTGGTTTGCAGAGGCATTTGCACTATTACCCATTGCAACAG AGTAGTTTGCAATAGCTTTAGAATCAGGGCCGACTGCTGTTGCCCATATTCCTTTTGCTTGAGCTTGATA ACCTAATGCAATAGCAGCGAGTGCTGTTGCATTTGCTCTTTGACCTAATGCGGCAGAACTTCCTGCTGTT GCATTTGCTTGCGTACCTACAGCTGTACCGCTTGAACCGCTTGCATTTGCGCCCTGACCAATAGCGGTGG TGCTAACATTAGTTGCTCTTGCCGAACCAATGGCGACAGAATTAGTTCCTGTCGCATTACTGTAAGAACC AATTGCAGTTGCATTTGTGTTTATTGCAGAAACTCGATAACCTAAAGCAACCGATGCAGATTGTGTAGAA TTTGATTCTTGCCCAATGGAAATTGAACTTTGTCCTGAAGCCTTGGCATCTTTACCAATCACTACAGTTG ATGTGTTAGCACTAGTTGCGTTTGTACCAACAACAATGGCATCATAATCCGTTCCTTTCGTTCTAGCATT TCGACCAATTACGGTTGCATTAAGACCCGTTGCGGTTGCATTTGTACCCAAAGCAATGCTGTAGTCGTAG TTTGCTTTAGATTCATCGCCAATTGCAATTGAGCTGTTGAGAGAGGCGCTTGCGTTAGGGCCAATTGCGA TAGAGTCTGTACCTGTTGCGCCAGCGGTTTCGTTATATTTGCCTTTATTGCCAGTTTTTGCGGAATTGAC GTGCAAATAACTTGTTTGGTTGTTAAGTGTGGTTTCAAGGGTAGTTGCTTTTGCTAATGCTGTACTTGCA TTCGATTTCGCTTCTGCCGCTGCAGTCGCAGCTGAGGTTGCTGCAGTTAATGCTGAATTTGCTGTGCTTG CAGCAGCGGTGACATTATCGTTTGTTTGCTTTAATTGTTTGCCTGTTACAGCCTCTGTACTTGCGGCTGT AAGTGCGGCGTCGGTTAATCCTGTAATTTTGTGATTTTTAGCATCTAGAGCAAAACCATTTTTACCAACT TCAATGCCGCCTGCAGCACCATTTTCTGTTGCTCCATCGGTGCCAGCATTATTCGCAACCCCAACTATGA CAGGTAATGTATTATTCTGTTCAACGGAGTTTGTAGCAGTGTTTCCCACCCCCAAATCATTTCTCGGAAC CGAAAACAGATCGCCATATCGTTTTTCAGCAAAAGCCTTGCTGGATAGCATTAGCATCGATAATGCCAGT AGGGTTAATGTAAAGGACGGTTTACCTTTGGCTGAGGCTATCCCCCCCCCCCCCCCCCCCCGCAGAAACA T

Protein sequence (NCBI) or Translate to protein
Restriction digest
BLAST
Design primers with primer3
Genome related info at NCBI

Gene(s) or part of gene(s) amplified:
ORF.. 1216557-1223207	Sequence	HICON_14020 caaA2 trimeric autotransporter adhesin (Protein is coded in complementary strand; from 1223207 to 1216557)