Sequence retrieval

Genome: Chlamydophila psittaci 01DC11
Start position: 217450
End position: 222843
Length: 5394

DNA sequence
>NC_017289, from 217449 to 222842 (5394 bp); Chlamydophila psittaci 01DC11 TTAGAATATCATACGTGCACCGCAGTTGGCCATCTGGACTAATGAAGACATTCCTGCTTCTACAGTGTAT GTACCATATAATGTCCAGTAAGGACCAAGATATATTTGTGAGCTATATTCCGCTCTTCCAGTATTTCTGG TTGGAATGACACCATACACTTGCCCAGTTTGTCCTGTAGAGTTCACTCTGTAATTACATTTAGGCTTGTT TCTGTAAATCACAGGTACATAAGCAAGGGATAATTTGTTATACATAAGAATATCATATTGCATTAATGCA CCTTCAAACACGAAACCTAAAGGTATAGAAAGATTTCTATAAGCGAAGGAGTCGAATGTTCTAGGATCAT AGTCAAGCTCTGTAAATTGCTTTTGACGTACTCCTGTGTACTCTGCTTCAGAGTAGAAAGAAAATCTTGT TGTAGAGTTTTGCGAAGGCTCTTTTAAGTCGAGAATCATACGGATATCAAACAACCAACCAAGATCTTCC CAATTTCCGAGATTGCGTTCATGAATTGATGGGTAATAGGTAGTTGTATCATGCTTCATATAGCCATATG TCATTACCCCTTGAAACAGTATAGGTCGAGGGGATTTCGTACGTTTATAAGGCAAATAAAAGGCTTTGCC GGTGTATAACGTCCCTTGGAAGGAGTGGTCAGAACCTTTATGCTTGTAATTATCTACAGCTTTTTCTGAT TTAGCGTGACCGAACACCTGGCTAAACGAAGCTCCAAGGATAAACTCAGGGCGTGGTTTAGCATCGATAG CCAATGAATAACCTCGGCTATGATAGGAGAAGGATCTTGATTCTTCTCCTTGTTCTTTTTGCAAGAACGA GCCTATACCACATAACCAAAGGTTATTGTAAGCAGCATCATCAAAACGTGCATTGTTAAGCATGTTGTTA ACAATACCTTGCTTTACAGCAATGAGAGAGTTTTGAGAACCGAGGATAGAGTTCACGTAGAAGTAGTTGT CTCTAGGGATGTAGATCCAGCGGCGGTACTCCTCAAACTTCCAATTCGCTTTGAGTGTTCCGTTTTGATC ACCTGATCCTAGAGTCCAAGAGCCAATATATCCCTTTAGAGGTTTGGTATCTCCTTCTAGAGTTAGGTTA GAGATCTCTACTTTGCTACTATCTGGGAGCTTGAGTAACTCAATCTGACGATCTTCACCTAAGTAAGGGT TTTGGTAAAAAGTCCCTGCAGGGTCGATAAGAGTAATTGTGCCTGTTAAATAGACTTTTTCCTGAGTTAC GTCTGGATTGGATACATTTGCTCGTGGTAGCAAGTCGTTCTTTTCCATACGAGCTCTAGGTCCTACTGCT GCTGCTGCAGGAGCTACACCTAATTTTAAAGCAGGAGGGGAGGCTGTTCCATCTTCTGAGACAATATCAC TAAAATCAATAGTGAGGTTGTTGATCGCTATGCCTCCAGTCGCCCCTGATCCACTCTTTTGCTGAGTAGA AAGTACGGCTCCTGGTCCCATCACAAGTGAAGATCCAGGTTTTTGATCGAAGGACGCCACATTTAACTCT GTATTTTTTCCTAAGATTAAGGTTCCGTCATGTAAGACAACCTTTTGGGGAATGACCGATTTATTCTCGT GGTATTCTGAAGAGAATAATACAGTTCCTGTGTACTTGGTAGGATTGCCTCCATTTGATGTTTTATTAAT ATCTAGAGTTTCGTAGCTATTACTAGAAGACTTAACTGTTTGAGTTCTTACAGCATCATAGAAATTAATC GATTGATTTGCTGCAGCGTTAAGAGTGAGTTTAACTTTTCCTGTAATACTGCAGAAAGAAGGCGCGACTT TTTGTTGTGCAGGTGCGCATTGGTTATTTTTAAATGTAATGCTACCGCCTAGGGCTGTAAGATTTAATTC CGCATCAGTGCTGCCATTTCCTTCCCCATAAATCGCTGCACCTAGATTATTAACCTGAGAGCGTTGTTGT GCTGGAGTTTGTGCTAGAGTTACCGTGTTATCCAGGAACACAATAGAAGCCGCTGCTGTGATGTCTGCCT TTTTTGTGAAGTAAATCGCACTACCGTCATTAGCAGAACTATTGTTCGAGAAGTTCATGTATCCTTGAGG AATGGATAACGTATCCGCGTAGATAGCACCACGGTTTTTCGCTATATTCCCTTCAAAGGAGCAGAACACG GGATCAGAGAATGTAACTGTACCATTGGAACCGTTTTTACAACCAATAGCTGAGCCGTTATCTGCAGAGT TCTCTTTGAAAAATAGTGCTTGGTTTCCTGTAAATGTAACGTTGGTTGTTCCTGCAATGGCTCCACCAAA GGTTGCCTTCGGCGTACCAGCTTTTGCAAGAACTTCTGCGGCAGGCTGTTCTTCTGGAGTGCATAAAGCA GAATTGCCTACAAAGTTTATGGGTTGTGAACAATTTTGAATTGTCACAGTAGGAGCATAAATCGCTCCAC CGGCTATTTGTCCTGTTGTAGTAGATCGTTTTGTTGTTGCCGAGTTTCCTGAGAAGGTTAAACTACCTGA GCTATTTTTAAGTGTGAAGCTCGTCTTAGCATAGATGGCCCCACCTTGAATATTAGGATCAGCAGGATCT TCAGGACTTGCTGTTTTGTTATCATCAATGACTTTGTTCCCAGAGAAGGCACAACTTCCGTGCAACTTTT CTATGGTCAACGTTTCAGCATAGAAAGCTCCACCTGTGATAGCAGTAGGAACACTGGATGCTCGTTGTTC TGATCTAGTAGTTGAGGTAACTTGCGCTTTGTTATTGCTTACAGTTAGTCCATCAGGGAAGTTAGTGCAG GTAAGTGCTTTGGCATAGATAGCTCCACCGGATTCTTTGGCAGTATTATCTGAAATATTTGAAATTTCTA TACCTTCAAGAGTCAGTGTTTCTGTGAAATACAGCCCACCACCGGATTTTCCTGCAGAGTTTCCAGTAAT ATTTAGGTGGTCTAGACGAGAGATCTTTCCTTTTCCCCCATAAACGCCCCCACCACTTTCTGTAGCAGTG TTTTTTGTTACATTGGCTGTAACGACATAATCAACCTTAAAGTCTAAATCTTCAGCAGATTGTGCTGCTA TTCCTGCAGCAACTACTGATGGAATGTTTGTGGTGCACAGTCCAGCTCCATTTTTAGCAGAGTTTTGACC GATATCGATTGATTTAAGGTTAGTTAATGAAGCTTGAGCTGTGTATACACCGCCACCATTTTCTGTGGCT GTGTTGCCAGTGATCACAGCACTTCCAAAGACAGGAACTATACCGGGTGTTGTAGAAGAGACAGTATCCG GATTAGAGAAGGTAAAGGAAAGTGCTTTAGGAATGTATGCTCCACCACCACTTTTTTTGGTGGTATTGTC CACTAAACAAAAGTTCTCTAGGTTGGATAAGTTTAGAGATTTTTGGTCAGCTAGACAGATACCCCCACCA TTTTCTTCCGCTGTGTTGCCTTGAAAGAGTGTTTTTCCTGTGAGGTTGGTAAAGGTCACATCGCTTTCGC AATACAGCCCGCCCCCAGATTTCTTTGAGGTGTTTGTGGTAAATTGTATTCTATGAGAATTGCTACAATT TAACGCTCCTTTGACGTACACACCTCCACCATGATCTGTGGCTTGGTTATTGATAAACTCTAAAATAGAA GTAATATTAGAAACTGTGAGAGCTTTCTCGACGTAGACACCGCCGCCTTTCCCTAAAGGAGGTACGATAG GTACGGGAGCTGATTGTTTTGCTACTGAGGAAGGCAGTGCTTGGGCAGCGGATGCTTCTGTATCTGGAAT AGTAATTTTGAGATCGTAGTTTCCAGCCTTGTTAACACCAAAACGGACTTGAGAAAGGTTAGTTAGGGTT ACGTCCCCTAGGGAATAGATAGCTCCACCACCTGTTTTCCCGTTGTTCGCATTAAATTGTGTGAGTATGG TGGAATCTTGTATTGTAAGATTCCCTTTTGAATAAATTGCTCCGCCTCGCGTATCTGCGGAGTTGCTTTG GAACCTTAAGTTCGCAATGTTATTTAGGGAGATGTCCTTATCTCCATAAATGGCACCTCCAGCTCCGGTA GCAGTATTTAATATAAAGAGGGTGTCTTCAGAGCCATCACGAATGGTAATGGTATCCAAGCCAAAAATGG CGCCTCCAGAGCCTTTAATCACAGGAGGAGCTTCTTGTGGTTGCTGTTTAGCCACCTCTGCAGAGGCTTG AACCCTTTCAGAAGCTGAGGGTAATGCTGCTGCTTTTTTCTGCGCATCAATTTTTTCTTTAATTACATCA ATAATCAGAGGAAATTCTGCAGAGTTTCCTCGGAAAGTCATATCTTTGTAAGTAGAGATGACAATAGCGC CTTTAGCAAAAATGGCACCTCCATTCCCTGCAGTTTCTGTCGTGTAGGTGGGGAATGTAGGTGTTTGAGT TCCTTCCTCTTTTACTGCTGCTTCTTGAGAGAAGTATCTAGGGAAGAGATGCGTTTCCTTGAATTTAGGA GGAACTAAACCGCCAATTCCAGATTCAGCTGCTGGTTGTGGTAGAACAGGAATCAGAGGAATAGGAACGC GAGCCGCGTTATTTGTAAATGCAATAGAGTTAAGGATATTCCTAATTGTCAGTGTGGAGTCGGTAAATAA AGCACCACCCGCTTGTTGGGATAGATCATCCTGGAATGTAAGGTTTTCTAAGCCATCAAAAGATATAGGA CCTTTGGAGTATATAGCTCCACCTTGTCCTGTCATTCTAATCAGGGTGCAGGATAAGGATCCTGGGTTTC CTGCATGTGTAATGAATGTTATAGGACCAGTTTTGTCATTGTAAAACGCACCCCCGCCTTTAGGAGCAGG AGTAGAAGTAGACGCATCTGTTGTGGAGGTAGTAACGGCAGGAGAAGATGCTGAAGATAATGAGAAACCT AGAGAGTTAGGTTTTTCATCTGTGAATTTCCCTATATCGAAAATTCCCTGATCCCCATCTAACACATGCG AAGCAAATGATGTAACATTCTGGTCATCTGGGCTATGATACAACTGTTCTTGAGGTTGTGTAAAAGCACT CTCATATCCTATTGAAGTGCTTAGCTTACTCTCGCTCTTTTGTTTGCTTGAGTTGGCACTACTCTGTGTA TCAGGAGCAGGAGAAGGAGGAGGAGTAGGAGCAGGTTCTACTACTCGAGTCGATTTAGCTTCAGGAATAT TCGTGAAATTTGTGAAAGAGACGTCCCCAGTGATGGTGTATGTTGTTCCGCTGTCATCTTTTGTTTGCTG CGTGAAATTCTTTGATGAAGAATCCGAAGCACTTAATCCCGATCCTCTGTAGCTGGAGTTTAATTCTTTC GAAAGAGGTTCACTAAATACTGTAATCGAGGGGAGTACGGCAGCAAAAACAGCTGTAGCTGATAGCCACT TCAT

Protein sequence (NCBI) or Translate to protein
Restriction digest
BLAST
Design primers with primer3

Gene(s) or part of gene(s) amplified:
ORF.. 217450-222843	Sequence	CPS0A_0237 pmp1B polymorphic outer membrane protein B family protein (Protein is coded in complementary strand; from 222843 to 217450)